本市自縣市合併以來，對於行政效能及為民服務品質之提升相當重視，而戶政所係第一線為民服務機關，著實需要完善的政府政策，本市各區戶政事務所自縣市合併以來為精進人力運用提高組織效能，自100年開始進行規劃戶政事務所改造，期以透過戶所組織改造來達成人力精實與提高組織效能的目的，至今完成規劃並預計本(106)年7月3日進行組織改造生效。
此次戶政組織改造在組織面，本市參考99年縣市合併成功經驗，對於此次戶所改造針對現有依循37行政區所設置的37區戶政事務所進行全面檢討，將戶政所擴大組織規模，內部組織整合成18個機關以結合內部管理，並保持原有37區戶政事務所服務據點，由18個機關分別管理1-4個戶政事務所據點，來達成組織改造但服務據點不變之整併目的。故在此次戶政組織再造因只針對內部組織改造，在對外為民服務上，仍維持有37個戶政事務所據點全方位的為民服務，各戶政事務所據點仍維持受理原有各項民眾申請案，因此民眾無需對於組織的再造作任何改變來適應。
在人力、物力面，此次戶政事務所組織改造將戶政所內部組織進行改造，在原有37個戶政事務所據點下將37位主任人力縮減為18位以快速因應對於戶政事務所據點的管理，來達到管理流程再造的目的。並對於1-4個戶政事務所據點透過組織改造使重複性內部業務(如人事、主計、專案管理等)得以統籌辦理，藉以精實與活用人力。此外本次組織改造重點之一在於讓此1-4個戶政事務所據點，可對於因人員差假所產生之人力窘迫上，得以快速相互調派服務民眾，提高服務效能。而對於服務設備的調撥與備品因應上，亦可快速調配及降低備品儲存，以達到活用人力、物力的目的。
本市在組織改造整併過程中，係採溫和、循序漸進的方式，秉持著以人為本的整併理念，在主任方面，為利戶政所組織改造作業之進行，主任職缺自100年起採遇缺不補之方式，目前已由37位主任循序漸進縮減至18位，除由鄰近戶政所主任代理導入新觀念新思維外，也為整併前期作業培養基層主管人才，由戶政所資深人員代理管理工作，並在三不變（服務據點不變、服務項目不變、人員權益不變）及三改變（內部流程管理改變、人力經費設備活化改變、組織運作結構改變）之原則下，以「戶政所的改變來因應民眾的不改變」，從民眾角度出發，大步向前，辦理一次到位之37戶政事務所組織改造作業。
有關戶政所整併前置作業，本局業已規劃完畢，就主管與戶所同仁進行組織再造前教育訓練，並請所轄各戶政所依據期程落實辦理組織改造作業，期望藉由戶政所整併，創造合理經濟規模的組織環境，並調整組織體質及活絡組織運作，提升行政效能，從溪北到溪南，從市區到山區，打造嶄新的、特色的南市戶政機關新形象，達到山海共榮，城鄉同步發展的戶政新願景，服務再升級。